Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms