Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRSAM1Q6UWE0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms