Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L2Q6R6M4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L2Q6R6M4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms