Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETMD1Q6P1Q0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms