Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NANOGP8Q6NSW7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms