Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZKSCAN2Q63HK3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms