Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF20Q5VTR2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms