Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PERM1Q5SV97 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PERM1Q5SV97 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms