Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms