Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACSM3Q53FZ2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM3Q53FZ2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACSM3Q53FZ2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms