Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRNQ4KMQ1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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