Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KNOP1Q1ED39 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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