Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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