Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SGCAQ16586 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCAQ16586 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms