Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERC3Q15034 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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