Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS1Q14691 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS1Q14691 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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