Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMC2Q13753 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMC2Q13753 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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