Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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