Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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