Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP140Q13342 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP140Q13342 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP140Q13342 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SP140Q13342 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SP140Q13342 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SP140Q13342 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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SP140Q13342 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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SP140Q13342 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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SP140Q13342 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SP140Q13342 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SP140Q13342 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SP140Q13342 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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