Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LOXL1Q08397 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms