Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP4A11Q02928 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYP4A11Q02928 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms