Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF17Q02223 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF17Q02223 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms