Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIBQ01892 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms