Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms