Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms