Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVPABLB-1P60509 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVPABLB-1P60509 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms