Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCBP4P57723 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms