Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL35P42766 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms