Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms