Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms