Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms