Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGCP20142 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGCP20142 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGCP20142 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGCP20142 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms