Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD4O95243 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD4O95243 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD4O95243 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD4O95243 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD4O95243 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD4O95243 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD4O95243 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD4O95243 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms