Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms