Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSNA1O43805 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms