Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms