Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXND1Q9Y4D7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLXND1Q9Y4D7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms