Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX12Q9UMY4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms