Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms