Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCMF1Q9P0J7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCMF1Q9P0J7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms