Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3AQ9NVI7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3AQ9NVI7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms