Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BIN3Q9NQY0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms