Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms