Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKRIP1Q9H875 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms