Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms