Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCGF6Q9BYE7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms