Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HIGD2AQ9BW72 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms