Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF559Q9BR84 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms