Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRBNQ96SW2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms